A georeferenced database of the edaphic biota currently available for Argentina

データ レコード

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バージョン

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引用方法

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Sanabria M C V, Velazco V N, Tolosa G, Falco L B, Coviella C E (2023). A georeferenced database of the edaphic biota currently available for Argentina. Version 1.0. Test Organization #1. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.org/resource?r=org_biota_edafica_ar&v=1.0

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Instituto de Ecologia y Desarrollo Sustentable (INEDES)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.

GBIF登録

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キーワード

Ocurrence; Mites; Springtails; Earthworms; Oligochaeta; Georeferencing; Soil biota; Ecosistem services; Metacomunity; Land use; Soil biogeography

連絡先

地理的範囲

This work covers all of Argentina´s geography, as the collection of the information was performed as described above, for the entire territory of the country.

生物分類学的範囲

This data set of organisms of the edaphic biota in Argentina, covers different taxonomic levels of the Clitellata (Oligochaeta), Collembola, and Acari classes. It shows the Orders, Infraorders, Superfamilies, and Families widely recognized in the cited bibliography.

時間的範囲

プロジェクトデータ

The project aims to gather in a single, Open Access georeferenced database, all the currently available information on Acari, Collembola and Crassiclitellata (earthworms) for Argentina, and to relate that information, with the characteristics of the different soils in which each organism was collected. By having all the available information in a single site, we expect to provide a means to correlate presence of each taxonomic group, and the richness and structure of the different soil communities to the characteristics of the different soils of Argentina. The present work, provides the georeferenced database for all the Acari, Collembola, and Crassiclitellata described so far for Argentina. It is expected that this database will be enriched by different authors in the future, as more information becomes available.

プロジェクトに携わる要員:

収集方法

Database building A database was built containing all the information available for Argentina on Acari, Collembola, and Crassiclitellata taxa. The building of the base was carried out in two stages as described below.

Method step description:

1. Data collection: A comprehensive search was performed on the taxa of Acari, Collembola and Crassiclitellata for works carried out in the entire Argentina, since as back in time as possible. The works include theses from INEDES, online searches from Google Scholar, Scopus, and JSTOR, personal requests to authors mentioned in the bibliography, Universidad de Buenos Aires library and National Library. In each search engine it was necessary to use several different techniques to cover the largest number of publications:
2. In Scopus the following strings were used: ALL((microarthropods OR springtails OR mites OR oribatida OR mesostigmata OR prostigmata OR astigmata) AND ( argentina) AND soil AND (family OR genus OR species)) AND (LIMIT-TO (SUBJAREA, "AGRI") OR LIMIT-TO (SUBJAREA, "ENVI") OR LIMIT-TO (SUBJAREA, "MULT") OR LIMIT-TO (SUBJAREA, "EART")) AND (LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "Collembola") OR LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "Acari") OR LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "Soil Fauna")) AND (LIMIT-TO (LANGUAGE, "English") OR LIMIT-TO (LANGUAGE, "Spanish") OR LIMIT-TO (LANGUAGE, "Portuguese"));
3. ALL((microarthropods OR springtails OR mites OR oribatida OR mesostigmata OR prostigmata OR astigmata or earthworm) AND ( argentina) AND soil AND (family OR genus OR species)) AND (LIMIT-TO (SUBJAREA, "AGRI") OR LIMIT-TO (SUBJAREA, "ENVI") OR LIMIT-TO (SUBJAREA, "MULT") OR LIMIT-TO (SUBJAREA, "EART")) AND (LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "Collembola") OR LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "Acari") OR LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "Soil Fauna")) OR LIMIT-TO (EXACTKEYWORD, "earthworm")) AND (LIMIT-TO (LANGUAGE, "English") OR LIMIT-TO (LANGUAGE, "Spanish") OR LIMIT-TO (LANGUAGE, "Portuguese")).
4. In Google Scholar, the initial search was for each taxon in Argentina, eg. "Acari Argentina"; This search provided only few publications. Therefore, a search was implemented for each group in each province, such as “Acari Salta Argentina”, both in Spanish and English.
5. JSTOR database was used for searching older works. Additionally, if some work mentioned in a publication could not be found online or in libraries, the author was contacted directly to ask for the data. This was also the way unpublished works were obtained.
6. The occurrence records were georeferenced based on the information provided by each original work. In this way the occurrences were geographically located according to different strategies: a) if the work reported the exact coordinates, these were taken, b) if the publication referenced the sites in an image were interpolated using a GIS tool and this approximation was taken as valid, c) if the works did not present exact information on the geographical coordinates, they were geolocated to the closest locations using Google Maps or Google Earth, d) Always Where possible, the georeferenced locations requested from the authors of the original work were used.
7. Additionaly the biological occurrence of the different taxa found, as well as their geographical location, were recorded in this database, and we also ensured that the ownership of each scientific work was preserved, awarding the corresponding author to the registry.
8. Data integration: The synonymy used by each researcher to identify the original work was preserved, including the key and nomenclature used by the authors during the development of their research. However, the taxonomy and nomenclature have changed over the years. That is why current systematic listings were chosen for each group according to the current taxonomic structure.
9. In order to unify the nomenclature for Acari, the systematic lists of Subías 2022, and Pachl et al. 2020 in the suborder Oribatida were used for the Sarcoptiformes. For the infraorder Astigmata, as well as for the orders Mesostigmata and Trombidiformes, the list proposed in Zhang 2011 and Krantz and Walter 2009 was used.
10. For Collembola, we followed the criteria put forth by Deharveng 2004, Zhang 2011, and Bernava-Laborde and Palacios-Vargas 2020 . Were for works that used a different taxonomic level, or a type of classification that fell into disuse, the data were incorporated into the database at the higher taxonomic level.
11. For grouping the order Crassiclitellata, the information collected by Brown and Fragoso 2007, and by James and Davinson 2012 was used. Additionally, we also followed the considerations by Schmelz et al. 2021 that proposes updating in Oligochaeta (Annelida, Clitellata) to Order.
12. For all taxonomic groups, when a specimen was tagged with a question mark indicating an ID doubt (¿) or with the abbreviations aff. or cf. it was registered at the next higher level, eg the individual registered as Scheloribates aff. Bidactylus, is counted made as of the genus Scheloribates.

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